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保函保证金的会计核算是指企业在接受其他企业（包括政府部门）委托时，为了担保按照规定履行义务，向委托人支付的担保费用的核算。保函保证金的会计核算需要遵循中国《会计准则》及相关政策法规的规定，主要分为以下几个步骤：

1、确定是否支付保证金。即是否需要支付保函保证金，一般会遵循相关合同规定。

2、确定支付保证金的金额。一般按照合同规定的金额支付保证金，但实际支付的金额要求可能会有所不同，因此要确定准确的支付金额。

3、记录保证金的缴纳情况。一般需要在会计凭证中登记保证金的缴纳情况，为了保证凭证的真实性，一般会遵循国家以及行业的相关标准，例如《保证金付款凭证样本》。

4、结转保证金的支出。一般需要将保证金的支付登记到“主营业务成本”科目下，结转该笔费用。

5、将保证金的支出放入资产负债表中。根据《会计准则》的规定，保证金的支出应当作为长期负债，放入资产负债表中。

6、核查是否解除保证金。一般在合同结束后，要根据相关合同若干条款的规定，核查是否解除保证金。

7、核算保证金的解除差额。如果解除保证金，则需要核算保证金的解除差额，一般相关差额要放到“主营业务收入”科目中，例如作为“押金返还”。

拓展知识：

企业担保的方式有很多种，保函是最常见的担保方式之一，它是由担保人以书面的形式给出对其他担保方的担保承诺，通常是要求担保人向受保人支付抵押金，以表示担保人对受保人的承诺有信心。