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外购存货发生短缺的会计处理是企业财务会计的一个重要问题，企业在处理这种情况时应多加注意。

一般情况下，企业应采取直接从供应商处购买的方式来填补存货短缺部分，同时，企业还要向供应商索取费用等付款。在企业采取补充外购存货的行动过程中，应按照正常程序登记，明确购买时间、数量、价格、供应商等，并录入至会计账簿。

对于外购存货短缺的会计处理，还需要考虑不同科目的会计登记和处理规则。对于库存科目，存货明细账的期末余额要加上本期外购的数量；而在应付账款科目，要将本期进货额录入应付账款科目下，并设立外购存货明细帐，登记外购存货数量、价格、付款情况等。

此外，外购存货发生短缺的会计处理还要审查库存质量，并及时处理不合格品，进行合规处理，以达到精确核算存货数量的目的。

拓展知识：

外购存货发生短缺，企业除了要考虑妥善处理货物本身，还要注意保留证据，以确定最终的责任，以减少损失。此外，企业应定期对库存进行清点，并建立库存监督机制，进行实时监控，以便及时发现并解决库存短缺问题，防止业务中断。