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会计核算程序区别主要体现在以下几个方面：

1、账目核算方式不同：一般情况下，银行会计会使用“除数减去被除数”法核算账目，而非银行会计会采用“双项相加”法核算账目。前者是以账面余额为准，只要余额在允许的范围内，就可以核算出正确的账目；后者是以实际发生额为准，它对五类账目，即资产、负债、共同帐户、权益及损益要精确核算，只有到全部账目皆核实结果，才能正确核算出各项账目发生额。

2、用账方式不同：相对于非银行会计，银行会计的用账方式比较简单，主要用账面余额作为用账凭据。而非银行会计则同时注重于实际发生额，所以它会用实际发生额和账面余额双重用账的方式，这样更符合当前的会计核算要求。

3、核算检查方式不同：银行会计检查主要集中在余额变动上，而非银行会计则强调要验证账目发生金额是否正确，以及分析账目明细，因此它的检查比银行会计检查更加严格。

从上述可以看出，银行会计和非银行会计在核算程序上存在一些区别，但它们的目的都是为了保证会计数据的准确性，让会计工作更加规范，从而更好地服务于社会发展。

拓展知识：

随着社会经济发展，银行会计和非银行会计现在可以通过计算机软件系统进行核算，此种软件通常采取账项核算法，将账户实际发生额与账户余额相加，以防止双边账目核算错误，这样可以提高会计核算的准确度和效率，加强管理控制。