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如果实际发的工资跟申报的不一致，这可能是由于计算错误、支付给员工的补贴和其他收入未计算在内等原因导致的。因此，首先要判断原因，是由于计算错误还是由于以上原因导致。如果发现是由于计算错误，那么可以采取相应纠正措施，以便在下次工资发放时避免出现此类情况。如果是由于前述原因，则应该对实际发放的款项进行相应的核实。可以通过确认员工收到的补贴、其他收入等情况，确定应发放工资的金额。同时，如果发现实际发放金额比申报金额要高，则可能会受到财务部门的惩罚，因此这也需要进行相应的处理和调整。

此外，要尽可能避免出现上述情况，可以采取以下措施：

首先，严格执行国家有关财务管理的相关法律法规；其次，确保计算工资时细致周全，避免工资的计算出现误差；再次，加强对员工的补贴和其他收入的管理，如果有必要，应该建立相应的登记制度，以确保工资发放时准确无误。

拓展知识：除了上述措施，在实际管理中，可以将财务管理的职责分散给不同的部门，如财务部、人力资源部等，对此部门有关的工作规定明确，同时要实施定期复核，确保财务管理准确及时。另外，也可以采用实施计算机辅助工资管理的办法，以避免计算误差的发生，确保发放的工资准确无误。