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高新技术专项基金会计分录是将高新技术专项基金投入及支出各项财务活动进行细分记账并录入账簿，供管理方及会计人员查阅参考的操作。

1.发放资金分录：贷方借记专项基金，贷方借记预付款项；

2.支付费用分录：借方记账，借方记账各种支出，贷方借记专项基金；

3.结算分录：借方记账其他应收款，贷方借记预付款项，借方记账各种支出，贷方借记专项基金；

4.收款分录：贷方借记专项基金，借方记账应收账款；

5.结转分录：借方记账专项资金，贷方借记专项基金；

6.调节分录：贷方借记预付款项，借方记账专项基金；

7.确认分录：借方记账专项基金，贷方借记应交税费。

以上是高新技术专项基金的会计分录。值得注意的是，对高新技术专项基金的记录要准确、完整，并且要根据法律法规等规定做好核算，以免发生错误。

除了会计分录以外，在进行高新技术专项基金管理时，还应注意基金管理的规划、监督、报告、审核等工作，严格按照规定执行，确保基金项目的顺利实施，以及安全合法的管理。