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小型微利企业的认定程序是指依据《国务院关于商业企业分类管理的规定》（国发〔2008〕48号），对商业企业的规模进行定类，分别为大中小型和微型微利商业企业。

具体步骤如下：

1、依据规定，对商业企业除营改增减税以外的营业收入，和新增实物资产的投资总额，以及期末实物资产总额，按省、自治区、直辖市人民政府规定的标准，进行定类；

2、如果营改增减税后的营业收入，以及新增实物资产的投资总额，或期末实物资产总额达到了该省、自治区、直辖市人民政府规定的大中型商业企业标准，则分类为大中型商业企业；

3、如果营改增减税后的营业收入，以及新增实物资产的投资总额，或期末实物资产总额未达到了该省、自治区、直辖市人民政府规定的大中型商业企业标准，但有一项达到该规定标准，则分类为微型微利商业企业；

4、如果营改增减税后的营业收入，以及新增实物资产的投资总额，或期末实物资产总额均未达到了该省、自治区、直辖市人民政府规定的大中型商业企业标准，则分类为小型微利商业企业。

通常情况下，小型微利商业企业的营改增减税后的营业收入，以及新增实物资产的投资总额，或期末实物资产总额达到了该省、自治区、直辖市人民政府规定的5000万元以下的标准，或1000万元以下的标准，而有一项达到该规定的标准，则分类为小型微利商业企业。

小型微利商业企业在税收优惠、融资支持、存贷比限制等方面，都会享受比大中型企业更多的政策优惠，因此认定为小型微利企业对于企业的发展非常关键。

拓展知识：

微利企业是指在一定时期内，其营业收入较小，但收入中的盈利部分占一定比例，相当于同行业中主要企业的盈利水平。微利企业的企业文化一般比较简单，经营范围也较窄，但是微利企业的企业文化会比较活跃，更加务实，追求技术创新等。