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农业生产成本的二级科目设置有别于一般企业，特别是一些经营较多的企业，大部分是采用多番科目的以及详细科目的形式，这些科目的设置主要围绕农业生产成本变化的特点来进行。

1、材料费：主要包括农业生产所使用的农药、肥料、小麦、玉米、马铃薯等农产品以及蔬菜、花卉等非农产品。

2、劳动费：这个科目是农业生产中至关重要的费用，包括农民雇佣的和农业机具提供的劳动力，这个科目的计算是以月为单位的，以每月工资计算。

3、租赁费：主要指农业生产这些时期都要租赁的生产用具，如农具和农机等，这部分费用要根据每月租赁时长等来计算。

4、水电费：这部分费用是比较容易算的，主要指农业生产所使用的水电、煤气等费用，以每月使用量计算。

5、修理费：指农业生产所需要修理的机具等，以修理费用计算，包括拆卸费用，合同费用等。

6、运杂费：指农业生产过程中所产生的运费、工资、保险等费用，以每月实际产生费用计算。

7、保险费：指农业生产过程中为保障财产安全所交纳的保险费，以每月实际交纳费用计算。

8、管理费：指农业生产过程中所产生的管理费用，包括农场管理费、农业经理费等，以每月实际产生费用计算。

9、损耗费：指农业生产过程中产生的损耗，包括破损的农资、腐烂的农作物、劳动不良等，以实际损耗量计算。

10、税金：指农业生产过程中产生的相关税费，以每月实际缴纳税金计算。

农业生产成本的二级科目设置是根据农业生产的特殊性来设置的，考虑了农业生产中的物料投入、劳动、易耗品、租赁、水电、维护、运输、损耗、税收等多种因素，只有正确定义这些明细科目，才能准确分析、核算农业生产成本，为农机、农药、肥料、作物种植等投入的节约和合理安排提供有效的参考依据。

拓展知识：农业生产成本不仅是计算农业生产的经济性，而且可以把握投入和收入的比例，有助于发现农业生产中存在的问题，帮助农民科学管理农田，提高农业生产的效率。